Limnologia é a ciência que estuda os fenômenos físicos e biológicos relativos aos lagos, rios, estuários e zonas úmidas. Foco principal deste Programa, que contempla ainda outros dois subprogramas, o de Monitoramento Limnológico e de Qualidade da Água e o de Monitoramento de Macrófitas Aquáticas, que são as plantas que interferem na qualidade aquática.
- Subprograma de Monitoramento Limnológico e de Qualidade da Água
O objetivo geral deste Subprograma é monitorar as variáveis limnológicas (físicas, químicas e biológicas) e da qualidade da água do rio Teles Pires, em trechos localizados na Área de Influência Direta (AID) da Usina Hidrelétrica Sinop, com o intuito de prever e mensurar as modificações nesses atributos ambientais em decorrência das transformações do ambiente resultantes da implantação e operação do Empreendimento.
- Subprograma de Monitoramento de Macrófitas Aquáticas
Este tem dois objetivos específicos: além de caracterizar a comunidade de macrófitas (plantas) aquáticas na Área de Influência Direta (AID) da Usina Hidrelétrica Sinop, ao longo da implantação do Empreendimento até o início de sua operação, irá monitorar a distribuição de espaço e tempo da ocorrência dessas plantas no futuro reservatório, afim de identificar a necessidade de eventuais medidas de controle que assegurem a integridade dos usos múltiplos, a saúde pública e a geração de energia elétrica pretendida para a Usina.